MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	GCA	3	9	59	67	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858973
2	NC_017817	AATT	2	8	139	146	50 %	50 %	0 %	0 %	386858973
3	NC_017817	TAA	2	6	171	176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858973
4	NC_017817	GTA	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858973
5	NC_017817	ATC	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858973
6	NC_017817	TCC	2	6	340	345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858973
7	NC_017817	AAG	2	6	360	365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858973
8	NC_017817	ATTC	2	8	381	388	25 %	50 %	0 %	25 %	386858973
9	NC_017817	AAT	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858973
10	NC_017817	CT	3	6	428	433	0 %	50 %	0 %	50 %	386858973
11	NC_017817	CATCAC	2	12	469	480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858973
12	NC_017817	CAT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858973
13	NC_017817	CT	3	6	742	747	0 %	50 %	0 %	50 %	386858974
14	NC_017817	CTT	2	6	759	764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
15	NC_017817	TCT	2	6	795	800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
16	NC_017817	TCT	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
17	NC_017817	AAC	2	6	824	829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858974
18	NC_017817	CTG	2	6	849	854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
19	NC_017817	ATT	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858974
20	NC_017817	GCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
21	NC_017817	CTT	2	6	903	908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
22	NC_017817	AAC	2	6	911	916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858974
23	NC_017817	CACT	2	8	936	943	25 %	25 %	0 %	50 %	386858974
24	NC_017817	TCC	2	6	985	990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858974
25	NC_017817	TCT	2	6	1052	1057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
26	NC_017817	TCTCC	2	10	1083	1092	0 %	40 %	0 %	60 %	386858974
27	NC_017817	TGC	2	6	1114	1119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
28	NC_017817	CTG	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
29	NC_017817	CACTTG	2	12	1218	1229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386858974
30	NC_017817	TA	3	6	1281	1286	50 %	50 %	0 %	0 %	386858974
31	NC_017817	CTT	2	6	1455	1460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
32	NC_017817	CTG	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
33	NC_017817	T	6	6	1521	1526	0 %	100 %	0 %	0 %	386858974
34	NC_017817	TCT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
35	NC_017817	TTTA	2	8	1573	1580	25 %	75 %	0 %	0 %	386858974
36	NC_017817	C	6	6	1632	1637	0 %	0 %	0 %	100 %	386858975
37	NC_017817	CTT	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858975
38	NC_017817	CAG	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858975
39	NC_017817	CTC	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858975
40	NC_017817	CTC	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858975
41	NC_017817	TTCC	2	8	1703	1710	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
42	NC_017817	CAC	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858975
43	NC_017817	ATT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858975
44	NC_017817	CT	5	10	1802	1811	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
45	NC_017817	CT	4	8	1814	1821	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
46	NC_017817	TCT	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858975
47	NC_017817	TCT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858975
48	NC_017817	ATTTTC	2	12	1849	1860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386858975
49	NC_017817	CCT	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858975
50	NC_017817	T	7	7	1879	1885	0 %	100 %	0 %	0 %	386858975
51	NC_017817	GAAT	2	8	1930	1937	50 %	25 %	25 %	0 %	386858976
52	NC_017817	TAA	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858976
53	NC_017817	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858977
54	NC_017817	ACT	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
55	NC_017817	CTT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858977
56	NC_017817	CTT	2	6	2210	2215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858977
57	NC_017817	TTG	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858977
58	NC_017817	AGC	2	6	2296	2301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
59	NC_017817	ACC	2	6	2317	2322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858977
60	NC_017817	CAT	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
61	NC_017817	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	386858977
62	NC_017817	CTC	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858977
63	NC_017817	CTC	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858977
64	NC_017817	TGC	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858977
65	NC_017817	CTTT	2	8	2499	2506	0 %	75 %	0 %	25 %	386858977
66	NC_017817	TAG	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858977
67	NC_017817	CAT	2	6	2517	2522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
68	NC_017817	CAG	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
69	NC_017817	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858977
70	NC_017817	TCACCA	2	12	2564	2575	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858977
71	NC_017817	CAG	2	6	2580	2585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
72	NC_017817	GCA	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
73	NC_017817	TTA	2	6	2609	2614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858977
74	NC_017817	TAC	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
75	NC_017817	CTA	2	6	2658	2663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
76	NC_017817	CAT	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858978
77	NC_017817	CAT	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858978
78	NC_017817	ATT	3	9	3388	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858978
79	NC_017817	ACT	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858978
80	NC_017817	CTT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858978
81	NC_017817	TC	3	6	3431	3436	0 %	50 %	0 %	50 %	386858978
82	NC_017817	CCT	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858978
83	NC_017817	T	7	7	3460	3466	0 %	100 %	0 %	0 %	386858978
84	NC_017817	CTTT	2	8	3467	3474	0 %	75 %	0 %	25 %	386858978
85	NC_017817	T	6	6	3480	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	386858978
86	NC_017817	A	6	6	3506	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	386858978
87	NC_017817	AAAT	2	8	3513	3520	75 %	25 %	0 %	0 %	386858978
88	NC_017817	TA	3	6	3528	3533	50 %	50 %	0 %	0 %	386858978
89	NC_017817	TC	3	6	3674	3679	0 %	50 %	0 %	50 %	386858979
90	NC_017817	TTAT	2	8	3688	3695	25 %	75 %	0 %	0 %	386858979
91	NC_017817	TGC	2	6	3792	3797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
92	NC_017817	AGC	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858979
93	NC_017817	ACC	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858979
94	NC_017817	GCT	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
95	NC_017817	ATA	2	6	3865	3870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858979
96	NC_017817	T	7	7	3876	3882	0 %	100 %	0 %	0 %	386858979
97	NC_017817	TAT	2	6	3902	3907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858979
98	NC_017817	CTT	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858979
99	NC_017817	CTG	2	6	3932	3937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
100	NC_017817	TGC	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
101	NC_017817	TAG	2	6	3956	3961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858979
102	NC_017817	CAGAAA	2	12	3980	3991	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386858979
103	NC_017817	AT	3	6	4001	4006	50 %	50 %	0 %	0 %	386858979
104	NC_017817	TTG	2	6	4028	4033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858979
105	NC_017817	TGC	3	9	4038	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
106	NC_017817	TTG	2	6	4047	4052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858979
107	NC_017817	CCA	2	6	4060	4065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858979
108	NC_017817	TTTCT	2	10	4098	4107	0 %	80 %	0 %	20 %	386858979
109	NC_017817	TAG	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858979
110	NC_017817	CTA	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858979
111	NC_017817	CAT	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858979
112	NC_017817	CAC	2	6	4244	4249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858979
113	NC_017817	ATC	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858979
114	NC_017817	CTT	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858979
115	NC_017817	TAA	2	6	4322	4327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858979
116	NC_017817	TCA	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858979
117	NC_017817	TTC	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858979
118	NC_017817	ATTT	2	8	4388	4395	25 %	75 %	0 %	0 %	386858979
119	NC_017817	TTG	3	9	4409	4417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858979
120	NC_017817	T	7	7	4448	4454	0 %	100 %	0 %	0 %	386858979
121	NC_017817	C	6	6	4588	4593	0 %	0 %	0 %	100 %	386858979
122	NC_017817	ACTT	2	8	5008	5015	25 %	50 %	0 %	25 %	386858980
123	NC_017817	TAAT	2	8	5020	5027	50 %	50 %	0 %	0 %	386858980
124	NC_017817	A	6	6	5084	5089	100 %	0 %	0 %	0 %	386858980
125	NC_017817	CT	4	8	5147	5154	0 %	50 %	0 %	50 %	386858980
126	NC_017817	AAG	2	6	5171	5176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858980
127	NC_017817	TTTA	2	8	5214	5221	25 %	75 %	0 %	0 %	386858981
128	NC_017817	AAC	2	6	5224	5229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858981
129	NC_017817	CCA	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858981
130	NC_017817	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858981
131	NC_017817	CAG	2	6	5382	5387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858981
132	NC_017817	CTT	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858981
133	NC_017817	AGC	2	6	5413	5418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858981
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135	NC_017817	TAG	2	6	5484	5489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858981
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